4. 擴增產物出現(xiàn)多條帶 （雜帶）

（1）引物用量偏大，引物的特異性不高。應調換引物或降低引物的使用量。

（2）循環(huán)的次數(shù)過多。適當增加模板的量，減少循環(huán)次數(shù)。

（3）酶的用量偏高或酶的質量不好，應降低酶量或調換另一來源的酶。

（4）退火溫度偏低，退火及延伸時間偏長。應提高退火溫度，減少變性與延伸時間，也可采用二種溫度的PCR擴增。以2度為梯度設計梯度PCR反應優(yōu)化退火溫度。

（5）樣品處理不當。

（6）Mg²⁺濃度偏高，因適當調整Mg²⁺使用濃度。

（7）若為PCR試劑盒，也可能時試劑盒本身質量有問題。

（8）復制提前終止。使用非熱啟動的聚合酶時常有發(fā)生。冰上準備反應體系或采用熱啟動聚合酶。

（9）反應緩沖液未全融化或未充分混勻。確保反應緩沖液融化全并徹底混勻。

（10）引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設計引物。

（11）引物量過多。減少反應體系中引物的用量。

（12）模板量過多。質粒DNA的用量應<50ng，而基因組DNA則應<200ng。

（13）外源DNA污染。確保操作的潔凈。