病毒吸附在細胞表面含唾液酸的糖蛋白受體上，然后通過受體介導的細胞內吞作用，病毒進入細胞。這包括暴露于核內體內的低pH，導致HA的構象改變介導膜融合。這樣，核衣殼便進入胞漿并移向胞核。流感病毒利用獨特的機理轉錄。啟動轉錄時，病毒的核酸內切酶從宿主細胞的mRNA上切下5′帽子結構，并以此作為病毒轉錄酶進行轉錄的引物。產生出6個單順子的mRNA，并轉譯成HA、NA、NP和三種聚合酶(PB1、PB2和PA)。NS和M基因的mRNA進行拼接，每一個產生出兩個mRNA，依不同閱讀框架進行轉譯，產生NS1、NS2、M1和M2蛋白。HA和NA在粗面內質網內糖基化，在高爾基體內修飾，然后轉運到表面，植入細胞膜中，HA需要宿主細胞蛋白酶將其裂解成HA1和HA2，但兩者仍以二硫鍵相連，這種裂解可生成傳染性病毒，并以出芽方式從質膜排出細胞。