壓電打印原位合成的方式類似于噴墨打印機(jī),合成原理與傳統(tǒng)的核酸或寡肽固相合成技術(shù)相同。合成過(guò)程為:合成前以與光引導(dǎo)原位合成類似的方式對(duì)芯片片基進(jìn)行預(yù)處理,使其帶有反應(yīng)活性基團(tuán),例如伯氨基。同時(shí),將合成用前體分子(DNA合成堿基、cDNA和其它分子)放入打印墨盒內(nèi),由電腦依據(jù)預(yù)定的程序在xyz方向自動(dòng)控制打印噴頭在芯片支持物上移動(dòng),并根據(jù)芯片不同位點(diǎn)探針序列需要將特定的堿基合成前體試劑(不足納升)噴印到特定位點(diǎn)。噴印上去的試劑即以固相合成原理與該處支持物發(fā)生偶聯(lián)反應(yīng)。由于脫保護(hù)方式為酸去保護(hù),所以每步延伸的合成產(chǎn)率可以高達(dá)99%,合成的探針長(zhǎng)度可以達(dá)到40~50nt。以后每輪偶聯(lián)反應(yīng)依據(jù)同樣的方式將需要連接的分子噴印到預(yù)定位點(diǎn)進(jìn)行后續(xù)的偶聯(lián)反應(yīng)。類似地重復(fù)此操作可以在特定位點(diǎn)按照每個(gè)位點(diǎn)預(yù)定的序列合成出大量的寡核苷酸探針。