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兼并引物(Degenerate Primer)PCR

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-07-01

  密碼子具有兼并性,單以氨基酸順序推測編碼的DNA序列是不精確的,但可以設(shè)計(jì)成對兼并引物,擴(kuò)增所有編碼已知順序的核酸序列。用兼并引物時(shí)寡核苷酸中核苷酸序列可以改變,但核苷酸的數(shù)量應(yīng)相同。兼并度越低,產(chǎn)物特異性越強(qiáng),設(shè)計(jì)引物時(shí)應(yīng)盡量選擇兼并性小的氨基酸,并避免引物3’末端兼并,針對兼并的混合引物已成功地用于未知靶DNA的擴(kuò)增、克隆和序列分析,F(xiàn)已成功地克隆了豬尿酸氧化酶基因、糖尿病相關(guān)肽基因和哺乳動(dòng)物與禽類的嗜肝病毒基因。用脫氧肌苷(deoxyinosine;DI)引物進(jìn)行PCR,可以代替編碼蛋白的多種兼并密碼子中的兼并堿基,DI的特異性主要受cDNA濃度影響。

 

 

 

 
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