CCM為在Maxam-Gilbert測序法的基礎上發(fā)展的一項檢測突變的技術,其檢測突變的準確性可與DNA測序相仿。其基本原理為將待測含DNA片段與相應的野生型DNA片段或DNA和RNA片段混俁變性雜交,在異源雜合的雙鏈核酸分子中,錯配的C能被羥胺或哌啶切割,錯配的T能被四氧化餓切割,經變性凝膠電泳即可確定是否存在突變。該法檢出率很高,也是檢片段最長的方法,已有報功檢測了1.7kb片段,如果同時對正、反義鏈進行分析,檢出率可達100%。應用熒光檢測系統(tǒng)可增強敏感度,可檢測到10個細胞中的1個突變細胞。該法中的化學試劑有毒,又發(fā)展了碳二亞胺檢測法(catodiimide,CDI),CDI為無毒物質,也可檢測大片段DNA的點突變。