與個體發(fā)生同為E.H.Haeckel(1886)提倡的術(shù)語。追尋生物的各種族從發(fā)生到絕滅的形態(tài)變化,簡而言之,就是種族的歷史。而phylogenie一詞也就是關(guān)于這方面的研究(系統(tǒng)學(xué))。系統(tǒng)發(fā)生的研究,在現(xiàn)存生物的生物學(xué)中,是以比較解剖學(xué)、比較胚胎學(xué)和比較生物化學(xué)等作為基礎(chǔ)來進行的。在古生物學(xué)中是以追蹤各時代的生物遺跡,也就是化石來完成的。在19世紀(jì)的后半葉,根據(jù)生物發(fā)生律所追尋的系統(tǒng)發(fā)生是肯定可靠的,它也是促使比較胚胎學(xué)興盛的原因,但出現(xiàn)對此定律的種種批判,感到已達到了極限。但是進入本世紀(jì)后,由于貝爾(G.R.deBeer)及其他人對個體發(fā)生和系統(tǒng)發(fā)生的關(guān)系重新進行了研究而開辟了新的途徑。在古生物學(xué)的研究中,從W.H.Waagen(1869)對于菊石類(Ammo-nite)研究以來,直接探索系統(tǒng)發(fā)生,有不少成功的實例,如馬科、象科等的研究也包括在內(nèi)。不過若從整個生物界來看,通過化石的研究來確定系統(tǒng)發(fā)生的情況還是不多的。