管理體系明確規(guī)定了實驗室內(nèi)部各要素運行的基本規(guī)則，揭示了實驗室管理運行的內(nèi)在規(guī)律，是實驗室建立秩序和穩(wěn)定運行的基礎(chǔ)，按照管理體系規(guī)范運行，實驗室可塑造機構(gòu)公信力和影響力，樹立良好的品牌形象，提升自身適應(yīng)市場的能力，形成別人無法復(fù)制的核心競爭力。但在管理體系運行實踐中，有些實驗室存在三個誤區(qū)，需要保持清醒認識并予以克服。

一是管理體系規(guī)范運行是整個實驗室經(jīng)營管理的一部分，不是經(jīng)營管理的全部。管理體系規(guī)范運行目的是確保檢驗檢測活動的質(zhì)量，是經(jīng)營管理的基礎(chǔ)，并不能夠直接促成機構(gòu)自然而然的成長與發(fā)展。機構(gòu)要想實現(xiàn)成長與發(fā)展，仍需要做好市場營銷、打造管理和技術(shù)隊伍、良好的決策和適宜的企業(yè)文化，還在于經(jīng)營管理，不能用管理體系運行代替經(jīng)營管理。按管理體系規(guī)范運行不一定能夠獲得成功，但沒有管理體系的規(guī)范運行成功的可能性幾乎為零。一個有遠見有追求有定力的實驗室，應(yīng)是建立在管理體系規(guī)范運行基礎(chǔ)上的良好的經(jīng)營管理。

二是實驗室建立了管理體系，但需要管理層持續(xù)推動其實施和保持。按照管理體系運行，可實現(xiàn)實驗室制度化和標準化管理。但再好的管理體系也不會自動去運行，需要實驗室管理層帶領(lǐng)所有員工予以實施與保持，管理體系文件有了，還需要采取有效的管理和控制手段，不斷糾正運行中的問題，使大家能夠自覺按管理體系工作，不能忽視了管理層該做的管理和控制工作。實施管理體系是一個持續(xù)改進的過程，需要數(shù)年的打磨才能逐步穩(wěn)定成熟。管理體系文件是編寫出來的，但管理體系運行必然是摔打出來的。

三是實施和保持管理體系需要人力、物力和信息的持續(xù)投入。管理體系運行能力的保持是實驗室管理運行中的一個難點，管理體系運行并不是一次性投入就可萬事大吉，由于實驗室內(nèi)外部因素的變化、工作量和工作類型的變化等影響，會導(dǎo)致管理體系運行有效性下降，有時會因為一個關(guān)鍵崗位人員的流失導(dǎo)致管理運行要素較大面積的失效。實驗室要保持穩(wěn)定的運行，需要持續(xù)投入相應(yīng)的資源，不僅需要硬件方面的投入，也需要軟件方面的投入；不僅需要技術(shù)方面的投入，同樣需要管理方面的投入。投入的程度應(yīng)使本機構(gòu)始終保持管理和技術(shù)的平衡性和協(xié)調(diào)性，確保管理體系運行要素的完整性。